1、粒度大小：粉狀有機肥料的顆粒較細小，通常是粉末狀，而顆粒狀有機肥料則由粉末經過造粒成顆粒狀。顆粒狀有機肥料的粒度相對較大，形狀規整。
2、施用方式：粉狀有機肥料通常適合于均勻撒布或噴灑施用，通常使用手工施用。而顆粒狀有機肥料更適合于機械施用，如施肥器、播種機等。顆粒狀有機肥料的規則形狀和較大的粒度使得其在施用過程中更易于控制和定量。
3、適用情況：粉狀有機肥料適合于小面積施用、播種前與土壤混合或作為基肥使用。而顆粒狀有機肥料適合于大面積施用、機械施肥以及長效施肥等情況。
4、養分釋放速度：由于粉狀有機肥料的顆粒較小，表面積較大，養分釋放速度較快，能夠迅速供給植物所需的養分。而顆粒狀有機肥料由于顆粒較大，內部養分釋放速度相對較慢，需要在土壤中逐漸分解和轉化后才能供給植物。
5、儲存和運輸：粉狀有機肥料在儲存和運輸過程中相對較為敏感，容易飄散、潮濕或結塊。顆粒狀有機肥料由于顆粒形態規整，具有較好的流動性和包裝穩定性，更容易儲存和運輸。
