有機肥料的生產是一個農業廢棄物資源化的項目，生態有機肥料生產企業可大可小，國家沒有標準化要求。一般來說，規模化有機肥廠區規劃布局包括以下幾個分區部分：
有機肥原料堆肥
1）廠區大門和偏門
廠區大門是公司業務來往和成品銷售的通道。偏門則是糞便等惡臭原料的進廠通道。偏門一般緊挨發酵車間和原料倉庫，在廠區不顯眼的位置。
生產車間
2）職工生活區
職工生活、住宿、休閑、娛樂的地方。職工生活區一般遠離生產區域。生活區內可以種植蔬菜、花草樹木等，可以讓人賞心悅目。
3）設備存放區
生產車間設備布局
4）原料倉庫
5）發酵車間
6）半成品存放區
此處半成品是指原料經過無害化發酵結束后，等待加工暫時堆積存放的區域。
有機肥槽式發酵車間
7）加工車間
8）成品倉庫
需要提到的是：原料倉庫、發酵車間、半成品存放區、加工車間成品倉庫應該緊密連接，可以使企業工作效率大大提高。
9）辦公區
辦公區域應設置在生活區附近，利于工作和休息。
10）種植示范區
企業自己生產的生態配方肥料，可以通過自己的試驗田進行試驗，實時掌握肥料的應用效果。
